رهبر معظم انقلاب اسلامی در پی شهادت اسماعیل هنیه تأکید کردند: رژیم صهیونی جنایتکار و تروریست با این اقدام زمینه‌ی مجازات سختی را برای خود فراهم ساخت و خونخواهی او را که در حریم جمهوری اسلامی ایران به شهادت رسید، وظیفه خود می‌دانیم.

معاون اول رئیس جمهور در پیام تسلیت شهادت اسماعیل هنیه اظهار داشت: شهادت آقای هنیه رئیس به عنوان یکی دیگر از جلوه‌های «تروریسم دولتی» و از پیامدهای سکوت مجامع بین المللی در قبال جنایات مستمر رژیم صهیونیستی و نقض آشکار و پی در پی مقررات بین المللی است.

حسین عرنوس نخست وزیر سوریه با رئیس مجلس شورای اسلامی دیدار و گفت‌وگو کرد.

تولیت حرم امام خمینی(ره) در خصوص شهادت اسماعیل هنیه اظهار داشت: امیدوارم این شهادت‌ها مقدمه پیروزی نهایی آرمان فلسطین باشد.

رئیس مجلس شورای اسلامی در واکنش به ترور اسماعیل هنیه با بیان اینکه دو ملت ایران و فلسطین در آغوش یکدیگر داغدار این مصیبت بزرگ هستند، تاکید کرد: ایران اسلامی و جبههٔ مقاومت از خون برادر شهید خود نخواهد گذشت.

رئیس جمهور در دیدار معاون رئیس جمهور زیمباوه گفت: وحدت و همکاری کشورهای مستقل مثل ایران و زیمبابوه می‌تواند تحریم‌های آمریکا و کشورهای غربی را بی‌اثر کند.

سپاه در اطلاعیه‌ شماره ۲ اعلام کرد: بی‌تردید جنایت رژیم صهیونیستی با پاسخ سخت و دردناک جبهه مقتدر و عظیم مقاومت به‌ویژه ایران اسلامی مواجه و برکات مجاهدت‌های “شهید القدس” دکتر اسماعیل هنیه در دفاع از آرمان و حقوق ملت فلسطین یاری‌بخش آنان خواهد بود.

دبیر شورای نگهبان با تسلیت شهادت اسماعیل هنیه گفت: جبهه جهانی مقاومت باصلابت‌تر به مسیرش ادامه خواهد داد.

تشکل‌ها و اتحادیه‌های دانشجویی با صدور پیام‌هایی ترور اسماعیل هنیه در تهران را محکوم و آن را سرآغاز نابودی رژیم منحوس صهیونیستی دانستند.

مجلس خبرگان رهبری در بیانیه درخصوص شهادت اسماعیل هنیه تصریح کرد: بی‌تردید خون این شهید مجاهد، موجب همبستگی، تقویت جبهه مقاومت و فراگیری روحیه مبارزه علیه رژیم منحوس صهیونیستی است و در نهایت، حذف این ننگ بشریت از صفحه روزگار را سرعت خواهد بخشید.